奧林巴斯顯微鏡在主要操作有：調焦，視度調節(jié)，瞳距調節(jié)和燈泡更換幾個步驟。

　　調焦：將工作臺板放入底座上的臺板安裝孔內。奧林巴斯顯微鏡觀察透明標本時，選用毛玻璃臺板;觀察不透明標本時，選用黑白臺板。然后松開調焦滑座上的緊固螺釘，調節(jié)奧林巴斯顯微鏡的高度，使其與所選用的物鏡放大倍數大體一致的工作距離。調好后，須鎖緊緊固螺釘。調焦時，建議選用平面物體，如印有字符的平整紙張、直尺、三角板等。

　　視度調節(jié)：先將奧林巴斯顯微鏡左右目鏡筒上的視度圈均調至0刻線位置。通常情況下，先從右目鏡筒中觀察。將變倍手輪轉至較低倍位置，轉動調焦手輪和視度調節(jié)圈對標本進行調節(jié)，直至標本的圖像清晰后，再把變倍手輪轉至較高倍位置繼續(xù)進行調節(jié)直到標本的圖像清晰為止，此時，用左目鏡筒觀察，如不清晰則沿軸向調節(jié)左目鏡筒上的視度圈，直到標本的圖像清晰為止。

　　瞳距調節(jié)：扳動奧林巴斯顯微鏡目鏡筒，可以改變兩目鏡筒的出瞳距離。當使用者觀察視場中的兩個圓形視場完全重合時，說明瞳距已調節(jié)好。應該注意的是由于個體的視力及眼睛的調節(jié)差異，因此，不同的使用者或即便是同一使用者在不同時間使用同一臺顯微鏡時，應分別進行齊焦調整，以便獲得較佳的觀察效果。

　　燈泡更換：無論是更換上光源燈泡，還是更換下光源燈泡，在更換前，請務必將電源開關關上，電源線插頭一定要從電源插座上拔下。當更換奧林巴斯顯微鏡光源燈泡時，先擰出上光源燈箱的滾花螺釘，取下燈箱，然后從燈座上卸下壞燈泡，換上好燈泡，再把燈箱和滾花螺釘裝上即可。當更換下奧林巴斯顯微鏡光源燈泡時，需將毛玻璃臺板或黑白臺板，從底座上取出，然后從燈座上取下壞燈泡，換上好燈泡;再把毛玻璃臺板或黑白臺板裝好即可。奧林巴斯顯微鏡更換燈泡時，請用干凈的軟布或棉紗將燈泡玻殼擦拭干凈，以保證照明效果。

　　由于很多時候是因為我們在使用的時候沒有注意，將奧林巴斯顯微鏡放在潮濕的地方，有灰塵的時候又直接用手抹或者用布擦，在進行操作的時候喜歡用一只手拿鏡，從而導致了悲劇的事情發(fā)生，那用戶又該如何避免這樣的事情發(fā)生呢？

　　1、奧林巴斯顯微鏡是高端儀器，對環(huán)境有一定要求，放置的地方一定要有光，防潮，灰塵少，潮濕的環(huán)境容易導致奧林巴斯顯微鏡的損壞，影響功能，所以平時不用的時候要蓋上防塵布，以免進入灰塵。
　　2、進行操作時，必須要保持右手握臂、左手托座的持鏡姿勢，千萬不能一只手拿鏡，避免有的零件脫落或者碰撞到其它地方，對奧林巴斯顯微鏡造成損壞。
　　3、在調節(jié)物鏡和其他裝置的時候，要盡量小心，動作輕柔。因為它很多地方都用到調節(jié)，所以更要注意，調節(jié)不好容易損壞被觀察物體，也容易損壞儀器。更換物鏡和薄片時，要注意不要用力扳取。
　　4、使用者要注意保持奧林巴斯顯微鏡的清潔，其中光學和照明部分要求比較嚴格，做清潔時只能用擦鏡紙擦拭，擦鏡頭要用專業(yè)的擦鏡頭的紙擦，切動作不能過大。特別是杜絕用口吹、用手抹或者用布擦。不能讓酸性，堿性等試劑流入載物臺或者是鏡頭上，如果出現這種情況，應該及時擦干。
　　5、很大一部分人有單眼觀察的習慣，這種習慣在奧林巴斯顯微鏡的使用當中很不方便，應該保持兩眼同時睜開進行觀察，因為在左眼觀察視野的同時，右眼還要用來繪圖。
　　6、使用過程中要堅持輕拿輕放的原則，注意不要隨手把奧林巴斯顯微鏡放在實驗臺面的邊緣，防止一不小心碰翻落地。
　　7、在放置玻片標本時，必須對準通光孔的中央，切記不能反放，以免壓壞玻片或是碰壞物鏡。另外操作者對儀器不要隨意拆卸，以免損壞和影響使用效果。
　　8、使用完奧林巴斯顯微鏡，必須按照規(guī)定步驟進行復原，要檢查是否關好電源，然后放回鏡箱不要馬上蓋防塵布，要等到冷卻后在蓋上。還要將物鏡調節(jié)到較低狀態(tài)，平時要多檢查是否有螺絲松動。